English site

微生物 : Methanococcus maripaludis

微生物株情報

NBRC番号 101832
学名 Methanococcus maripaludis
別名(シノニム) Methanococcus deltae
由来 JCM 13030 <- DSM 14266 <- J.A. Leigh <- W.B. Whitman, S2
他保存機関番号 DSM 14266=JCM 13030
他株番号 S2
参考文献
9515920
The nif gene operon of the methanogenic archaeon Methanococcus maripaludis. (J Bacteriol. 1998)
15466049
Complete genome sequence of the genetically tractable hydrogenotrophic methanogen Methanococcus maripaludis. (J Bacteriol. 2004)

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseMMP1512
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseMMP1144
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinMMP1649 MMP0628
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMMP0345 MMP0205 MMP1651 MMP1095 MMP0975 MMP0514 MMP0507
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRMMP0020
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMMP1651 MMP0205 MMP0345 MMP0507 MMP0514 MMP0975 MMP1095
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinMMP0515 MMP0506 MMP0206
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinMMP0207
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterMMP0221
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSMMP0103
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTMMP1656

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA10632
ローカスタグ
INSDC entriesBX950229
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,661,137
遺伝子数 1,722
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of the genetically tractable hydrogenotrophic methanogen Methanococcus maripaludis. (J Bacteriol. 2004) PMID: 15466049

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
496.0 KB 450.8 KB 319.9 KB 139.9 KB