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微生物 : Caldilinea aerophila

微生物株情報

NBRC番号 104270
学名 Caldilinea aerophila
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 JCM 11387=DSM 14535
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCLDAP_12500
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseCLDAP_40140
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseCLDAP_37020
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseCLDAP_30880
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ICLDAP_30860
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseCLDAP_03470
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCLDAP_24620
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinCLDAP_22740 CLDAP_37530
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCLDAP_34170 CLDAP_13370 CLDAP_40070
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCLDAP_34170 CLDAP_13370 CLDAP_40070
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinCLDAP_40080
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinCLDAP_05980
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseCLDAP_41000
任意 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinCLDAP_20390 CLDAP_20100 CLDAP_18710
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseCLDAP_40950 CLDAP_10290
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSCLDAP_06630
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTCLDAP_15420

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDB47
ローカスタグCLDAP
INSDC entriesAP012337
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 5,144,873
遺伝子数 4,119
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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1.5 MB 1.4 MB 925.7 KB 319.5 KB