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微生物 : Acidithiobacillus ferrooxidans

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Acidithiobacillus ferrooxidans
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 ATCC 53993
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLferr_2441
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseLferr_2642
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseLferr_2845
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ILferr_2846
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須B
ARSB1
(NRULE_0015)
Arsenical pump membrane proteinLferr_2479
ARSC2
(NRULE_0018)
Arsenate reductaseLferr_2481
任意 
ARSH
(NRULE_0021)
ArsH proteinLferr_2478
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseLferr_0787
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseLferr_2107
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinLferr_1261
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinLferr_0050 Lferr_0044 Lferr_1211
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinLferr_0050 Lferr_0044 Lferr_1211
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainLferr_1239
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainLferr_1238
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseLferr_1240
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseLferr_1663 Lferr_0475
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Lferr_0475
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDLferr_0473
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseLferr_0476
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseLferr_0474
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFLferr_0712
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseLferr_2642
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthaseLferr_1740
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseLferr_1738
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseLferr_1739

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA16689
ローカスタグLFERR
INSDC entriesCP001132
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,885,038
遺伝子数 2,826
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
874.9 KB 834.3 KB 545.1 KB 219.0 KB