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微生物 : Chthonomonas calidirosea

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Chthonomonas calidirosea
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 DSM 23976
他株番号 T49
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCCALI_02154
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseCCALI_00544
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseCCALI_01216
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ICCALI_00911
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCCALI_00273
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseCCALI_01249
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinCCALI_00942
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseCCALI_00348
任意 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BCCALI_00349
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein ECCALI_00346
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseCCALI_00836
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2CCALI_00836
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDCCALI_00796
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseCCALI_00837
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseCCALI_00285
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFCCALI_02170
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSCCALI_02632
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTCCALI_00268

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJEB1573
ローカスタグCCALI
INSDC entriesHF951689
ステータスComplete Chromosome with gaps
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 343,786
遺伝子数 2,811
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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