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微生物 : Coprobacillus sp.

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Coprobacillus sp.
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 3_3_56FAA
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF1021_00435 HMPREF1021_01174
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-nucleotidyltransferase)(NFUNC_0042)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseHMPREF1021_02450
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須B
APH3
(NRULE_0156)
Aminoglycoside 3'-phosphotransferaseHMPREF1021_01850
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF1021_00601 HMPREF1021_01754
Human milk oligosaccharides metabolism(NFUNC_0083)
必須A
LNBP
(NRULE_0112)
1,3-beta-galactosyl-N-acetylhexosamine phosphorylaseHMPREF1021_01506
任意 
GALE
(NRULE_0111)
UDP-glucose 4-epimeraseHMPREF1021_01176 HMPREF1021_01099
Kanamycin resistance(NFUNC_0052)
必須C
APH3
(NRULE_0156)
Aminoglycoside 3'-phosphotransferaseHMPREF1021_01850
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF1021_00177
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseHMPREF1021_02450
任意 
APH3
(NRULE_0156)
Aminoglycoside 3'-phosphotransferaseHMPREF1021_01850

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA40019
ローカスタグHMPREF1021
INSDC entriesACWL01000000
ステータスScaffold
解析状況High-Quality Draft
コンティグ数31
サイズ(bp) 3,952,410
遺伝子数 3,955
フィニッシングゴールHigh-Quality Draft
アセンブル方法Newbler v. 2.3-PostRelease-11/19/2009
冗長度19x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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FASTA
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1.2 MB 1.1 MB 716.8 KB 295.8 KB