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微生物 : Coraliomargarita akajimensis

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Coraliomargarita akajimensis
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 DSM 45221=IAM 15411=JCM 23193=KCTC12865=MBIC 06463
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCaka_1154
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseCaka_1856
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ICaka_2017
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCaka_2953
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinCaka_1975
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCaka_2802 Caka_0249 Caka_1973
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRCaka_2078
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCaka_0249 Caka_1973 Caka_2802
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinCaka_1974
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinCaka_1975
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainCaka_2838
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainCaka_2837
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseCaka_2839
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseCaka_2406
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseCaka_2244
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseCaka_2235
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseCaka_2233

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA33365
ローカスタグCAKA
INSDC entriesCP001998
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,750,771
遺伝子数 3,120
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Coraliomargarita akajimensis type strain (04OKA010-24). (Stand Genomic Sci. 2010) PMID: 21304713

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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1.1 MB 1.1 MB 712.4 KB 236.9 KB