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微生物 : Dehalococcoides mccartyi

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Dehalococcoides mccartyi
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 BAV1
参考文献
12840758
Detoxification of vinyl chloride to ethene coupled to growth of an anaerobic bacterium. (Nature. 2003)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseDehaBAV1_1272
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IDehaBAV1_1271
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseDehaBAV1_0999
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2DehaBAV1_0999
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDDehaBAV1_1001
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseDehaBAV1_0998
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseDehaBAV1_1000
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFDehaBAV1_0577
Streptogramin resistance(NFUNC_0027)
必須A
VAT
(NRULE_0113)
Streptogramin A acetyltransferaseDehaBAV1_0994
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSDehaBAV1_0362
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTDehaBAV1_0573

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA15770
ローカスタグDEHABAV1
INSDC entriesCP000688
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 12,840,758
遺伝子数 1,371
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Detoxification of vinyl chloride to ethene coupled to growth of an anaerobic bacterium. (Nature. 2003) PMID: 12840758

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
406.8 KB 394.1 KB 260.3 KB 111.0 KB