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微生物 : Gemmata obscuriglobus

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Gemmata obscuriglobus
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 UQM 2246
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseGEMOB_RS09230
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IGEMOB_RS02845
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseGEMOB_RS28055
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseGEMOB_RS09325
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinGEMOB_RS14915 GEMOB_RS09130
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRGEMOB_RS41295
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinGEMOB_RS14915 GEMOB_RS09130
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseGEMOB_RS07745
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2GEMOB_RS07745
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDGEMOB_RS35630
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseGEMOB_RS13240
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseGEMOB_RS22950
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFGEMOB_RS05250
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseGEMOB_RS09650
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseGEMOB_RS41835 GEMOB_RS09645
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeGEMOB_RS28385 GEMOB_RS12450

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA20997
ローカスタグGEMOB
INSDC entriesNZ_ABGO01000001
ステータスContig
解析状況
コンティグ数922
サイズ(bp) 9,161,841
遺伝子数 7,436
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
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2.7 MB 2.0 MB 1.3 MB 549.7 KB