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微生物 : Mariprofundus ferrooxydans

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Mariprofundus ferrooxydans
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 PV-1
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseSPV1_14354
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseSPV1_12330
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ISPV1_12335
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBSPV1_12957
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseSPV1_12982
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseSPV1_11231
Ectoine biosynthesis(NFUNC_0056)
必須A
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseSPV1_00155
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseSPV1_00160
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseSPV1_00150
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinSPV1_03093
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinSPV1_03093
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseSPV1_02097
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseSPV1_02107
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseSPV1_13654
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseSPV1_02102

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA13615
ローカスタグSPV1
INSDC entriesAATS00000000
ステータスScaffold
解析状況
コンティグ数4
サイズ(bp) 2,867,087
遺伝子数 2,866
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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