MiFuP wiki

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MiFuP wiki とは?

MiFuP (Microbial Functional Potential) は、ゲノム配列情報から微生物の機能を推定するデータベースです。キーワード検索により、目的の機能が推定される微生物を手軽に検索することが出来る他、微生物のゲノム配列からの機能検索、NBRC 保有株のゲノム配列に対する相同性検索も可能です。MiFuP の機能定義は、NITE のアノテーターが一つ一つ実験情報に基づいて作成しており、複数の遺伝子により発揮される機能や必要な遺伝子の組み合わせが複数パターンある機能についても手軽に検索することが出来ます。
MiFuP wiki は、主にMiFuP に収録されている機能についての情報を日本語でまとめたウェブサイトです。機能を発揮するメカニズムや、実験されている生物とその論文情報、産業利用の例などの情報を得ることが出来ます。


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MiFuP wiki では、機能を物質分解、物質生産、環境適応の3つに分類しています。
各機能の Function_ID (例 NFUNC_0001) で検索したい場合は、Function ID 対応表 を参照して下さい。


category:物質分解
有機化合物分解 飽和炭化水素分解 アルカン分解 / ハロアルカン分解
芳香族炭化水素分解 トルエン分解 / トルエン分解 (トルエン 4-モノオキシゲナーゼ経路) / トルエン分解 (キシレン モノオキシゲナーゼ経路) / フェノール分解 / 安息香酸分解 / ジベンゾチオフェン分解 / アントラニル酸分解 / 4-ヒドロキシフェニル酢酸分解 / ナフタレン分解 / アニリン分解
芳香環開裂 メタ開裂経路 / オルト開裂経路
その他 1,3-ジクロロプロペン分解 / アゾ化合物分解 / チオシアネート分解
多糖類分解 アルギン酸分解 / ヒアルロン酸分解 / ムチン分解
アミノ酸分解 アルギニン分解
ポリマー分解 バイオプラスチック分解 / ポリウレタン分解
その他 加水分解性タンニン分解 / ヒトミルクオリゴ糖代謝 / フィチン加水分解


category:物質生産
食品添加物生産 ビタミン生産 リボフラビン生産 / 葉酸生産 / コエンザイムQ生産 / ビタミンK生産 / ピロロキノリンキノン生産 / パントテン酸生産 / ビオチン生産 / ビタミンB6生産 / ビタミンC生産
希少糖生産 プシコース生産 / アロース生産
生体アミン生産 ヒスタミン生産 / チラミン生産
その他 ヒトミルクオリゴ糖生産 / γ-アミノ酪酸生産 / シクロデキストリン生産 / エクオール生産
食品加工酵素生産 凝乳酵素 / マロラクティック発酵
合成樹脂生産 バイオプラスチック生産 / アクリルアミド生産
その他 アミノ酸リガーゼ / 氷核形成タンパク質 / アラニンラセマーゼ / ヒアルロン酸生合成 / アントラニル酸生産/ マイコサミン生合成


category:環境適応
金属耐性 水銀耐性 / ヒ素耐性 / メタロチオネイン
ストレス耐性 耐冷性 不凍タンパク質
耐浸透圧性 ベタイン生合成 / エクトイン生合成 / 浸透圧調節物質取り込み
耐乾燥性 トレハロース生合成
耐酸性 グルタミン酸依存酸耐性
薬剤耐性 マクロライド系抗生物質耐性 / アミノグリコシド系抗生物質耐性 / ベータラクタム系抗生物質耐性 / クロラムフェニコール耐性 / スルホンアミド耐性 / トリメトプリム耐性 / ブレオマイシン耐性 / ホスホマイシン耐性 / バシトラシン耐性 / ポリミキシン耐性 / ストレプトグラミン系抗生物質耐性 / バンコマイシン耐性
その他 ソルビン酸耐性 / ニトロゲナーゼ / モリブデン輸送 / 金属結合タンパク質 / 細胞外電子移動


お知らせ

  • 2014-02-25 MiFuP wikiを公開しました。