ゲノム解析部門(NGAC) / 好気性超好熱古細菌

ＮＩＴＥトップ＞バイオテクノロジー分野＞ゲノム解析部門(NGAC) ＞ゲノムプロジェクト＞好気性超好熱古細菌









	ゲノム情報データベース DOGAN

	二次代謝産物合成遺伝子データベース DoBISCUIT

	ゲノムとは？

	ゲノム解析とは？

	プロテオーム解析とは？

	ゲノム解析プロジェクト(マニュアルアノテーション)

	ゲノム解析プロジェクト(ホールゲノムショットガン)

	プロテオーム解析プロジェクト

	インフルエンザ等解析プロジェクト

ホームページのご利用について

好気性超好熱古細菌　(Aeropyrum pernix K1^T (= NBRC 100138^T))

　京都大学らが平成５年６月、鹿児島県十島村・小宝島の浅海底熱水噴出域から採取した好気性の超好熱菌で、嫌気性のPyrococcus horikoshii OT3^T (= NBRC 100139^T)との比較のためにゲノムの塩基配列を決定したものです。至適生育温度は90～95 ℃とOT3には及びませんが、世界中のゲノム解析データが公開されているものでは本菌は好気性超好熱菌の中で生育温度が最も高い微生物です。
　Pyrococcus horikoshii OT3^T(= NBRC 100139^T)と同じく超好熱菌であることから、生産される蛋白質や酵素は耐熱性を有する優れた特徴があり、化学、食品、医薬品など産業分野への応用が期待されています。
　平成１１年７月からデータ公開を行っています。

Aeropyrum pernix K1T 電子顕微鏡写真

山口 (NITE NBRC) 撮影

A. pernixのゲノムデータが以下のとおり変更になりました。(2006年6月）

ゲノムサイズ: 1,669,695 bp -> 1,669,696 bp (ポジション941,216に1塩基挿入)
ORF（遺伝子推定領域）:

ORF数: 2,694 -> 1,700
開始位置の変更になったORF数: 978
削除されたORF数: 1,128
新たに追加されたORF数: 134

ゲノムサイズ：	1,669,696塩基対（約1.67M bp）
ORF（推定遺伝子領域)：	1,700箇所
GC含量：	56.3％
発表論文：	Complete Genome Sequence of an Aerobic Hyper-thermophilic Crenarchaeon，Aeropyrum pernix K1.
	（クレンアーキオータに属する好気性超好熱性古細菌 Aeropyrum pernix K1ゲノムの全塩基配列）
	DNA Res. 6(2), 83-101 (1999) [supplement : DNA Res. 6(2), 145-152 (1999)]
データベース：	DOGAN
ＮＢＲＣ^*番号：	100138^T

(*) 生物遺伝資源部門（NBRC）ホームページ: http://www.nbrc.nite.go.jp/

	塩基配列決定時に使用したゲノムＤＮＡクローンの分譲について
	バイオテクノロジー本部（DOB）では、塩基配列決定時に使用したゲノムＤＮＡクローンの分譲を生物遺伝資源部門（NBRC）において行っています。

独立行政法人製品評価技術基盤機構
バイオテクノロジーセンター　計画課（東京）

〒151-0066
東京都渋谷区西原2-49-10
TEL：03-3481-1933　FAX：03-3481-8424

Mail：	bio@nite.go.jp
地図：	広域地図詳細地図［かずさ（千葉）／本所（東京）］