ゲノム解析部門(NGAC) / Thermosulfidibacter takaii のゲノム解析に係る共同研究事業先の公募について

ＮＩＴＥトップ＞バイオテクノロジー分野＞ゲノム解析部門(NGAC) ＞ Thermosulfidibacter takaii のゲノム解析に係る共同研究事業先の公募について









	ゲノム情報データベース DOGAN

	二次代謝産物合成遺伝子データベース DoBISCUIT

	ゲノムとは？

	ゲノム解析とは？

	プロテオーム解析とは？

	ゲノム解析プロジェクト(マニュアルアノテーション)

	ゲノム解析プロジェクト(ホールゲノムショットガン)

	プロテオーム解析プロジェクト

	インフルエンザ等解析プロジェクト

ホームページのご利用について

Thermosulfidibacter takaiiのゲノム解析に係る共同研究事業先の公募について

平成１９年１１月１２日
独立行政法人製品評価技術基盤機構

趣旨
　独立行政法人製品評価技術基盤機構（以下、「ＮＩＴＥ」という）では、バイオテクノロジー及びその産業化の技術基盤となる生物遺伝資源の利活用を促進するため、ＮＩＴＥが保有する生物遺伝資源のうち世界的に未解析である分類群を代表する微生物のゲノム解析等を行い、情報を整備し、それら生物遺伝資源に係る情報等を提供しています。
　また、社会的・政策的に意義のある微生物のゲノム解析等を、その要請に応じて積極的に実施しています。この度ＮＩＴＥでは、Thermosulfidibacter takaii ABI70S6^T株 (NBRC公開準備中)について、ゲノム塩基配列決定、アノテーション、遺伝子機能解析等のゲノム解析を行うことといたしました。
　つきましては、本事業において当機構との共同研究を希望する研究機関等は、次の要領に従いご応募下さい。
共同研究の概要
（１）目的
　 Thermosulfidibacter takaii ABI70S6^T株は、2003年に現・独立行政法人海洋研究開発機構の布浦らによって、沖縄トラフの海丘熱水活動域で分離された新規性の高い極限環境微生物で、電子供与体として水素、電子受容体として硫黄を用いて独立栄養的に生育します。
本菌は新属・新種として論文発表が予定されていますが、当所における16S rRNA遺伝子系統解析から、古細菌との分岐点に近いと考えられている一群のバクテリア系統（Deeply Branching Bacteria）に属し、その中でも特に古細菌との分岐点に近い距離に位置することが示唆されています。本菌のゲノム解析によって、バクテリアの起源、あるいは古細菌・バクテリアの共通祖先に関する研究の進展に大きな影響を与えるものと期待されます。
さらに、本菌の分離源周辺に関して、その生態学研究が進んでいるところであり、熱水生態系の研究にも大きく貢献するものと考えております。また、これまでの微生物で知られていない代謝系が見出される可能性が高いと考えられます。
　本共同研究では、Thermosulfidibacter takaii ABI70S6^T株のゲノム解析を行うとともに、本菌およびそれに由来する遺伝子資源の学術・産業利用を促進することを目的とします。
（２）共同研究の内容
　本共同研究では、ＮＩＴＥがThermosulfidibacter takaii ABI70S6^T株の塩基配列の決定を行うとともに、ＮＩＴＥと共同研究先が協力してアノテーションを実施することを予定しています。共同研究先は公開前の塩基配列情報や、ＤＮＡクローンを利用した研究開発を行うことができます。ＮＩＴＥにおける塩基配列の決定は、当初ゲノムサイズの8倍程度のデータをホールゲノムショットガン法で取得することとしますが、共同研究先との協議により、さらにＮＩＴＥ単独もしくは共同で追加の解析を行う可能性があります。
（３）研究予算及び実施場所
　研究予算については、ＮＩＴＥが実施する塩基配列の決定及びアノテーションに要する費用以外は、提案者側の負担とします。また、提案者側の研究実施場所については、原則として提案者側保有の施設とします。ただし、研究内容によっては、ＮＩＴＥの施設及び設備を一部利用することも可能です。
（４）共同研究契約
　本共同研究については、事業開始前にＮＩＴＥと共同研究契約を締結するものとします。
（５）共同研究事業の期間および開始時期
　本共同研究事業の期間は、当該共同研究契約の締結日から平成２０年度末までを予定しています。
　なお、事業の開始時期は、平成２０年２月を予定しています。

応募案内 　　　　　　

（１）募集期間
	平成１９年１１月１２日～平成１９年１２月２６日
（２）応募資格
	１）応募者として、次の要件を満たすことが必要です。
		(1)	共同研究を実施するために必要な研究施設を有する単独あるいは複数で共同研究を希望する研究機関（企業、研究組合、独立行政法人、公益法人、大学等）であること。
		(2)	上記目的の達成及び計画の遂行に必要な研究開発の人員並びに設備を有していること。
		(3)	本共同研究を円滑に遂行する際に必要な経営基盤を有していること。
		(4)	ＮＩＴＥが共同研究の進捗管理をするうえで必要とする措置を、適切に遂行できる体制を有していること。
	２）共同研究事業の内容として、次の要件を満たすことが必要です。
		(1)	知的基盤整備の観点から、本共同研究事業終了後に報告書（学術論文を含む。）を作成し、本共同研究事業により得られた成果のうち、塩基配列及びアノテーション情報等については、ＮＩＴＥから速やかに公開できること。
		(2)	本共同研究事業を複数の研究機関等で共同して実施する場合、各研究機関等間の明確な責任と役割が示されていること。
（３）応募方法
	共同研究を希望する応募者は、募集期間中に、次の提案書等を郵送（書留）又は持参にて提出して下さい。
	なお、提案要領等の書類が下記よりダウンロードできますのでご参照ください。

○提案要領	【ＰＤＦ】(304kb)	【Word Doc】(144kb)
○共同研究契約書（案）	【ＰＤＦ】(160kb)

共同研究先の決定等

（１）共同研究先の決定
	共同研究先の選定は、受理した提案書、ＮＩＴＥが必要に応じ別途行う調査等を基に所定の手続きに従い行います。
（２）選考基準
	１）	共同研究業務に関する提案書の内容が次の各号に適合していること。
		(1)	当該共同研究事業の目的がＮＩＴＥの意図と合致していること。
		(2)	ＮＩＴＥのゲノム解析の効率化に資するものであること。
		(3)	当該共同研究事業の方法及び内容等がＮＩＴＥの示す次の要件と合致し、かつ、優れていること。
			・	当該共同研究事業が、ＮＩＴＥが決定するThermosulfidibacter takaii ABI70S6^T株の塩基配列に関する情報の高付加価値化又は当該情報を利用した新規技術開発等を行うものであること。
			・	得られた成果が原則としてＮＩＴＥで公開できること。
	２）	当該共同研究等を行う体制が整っていること。
	３）	契約の締結・協議、研究の進捗管理や成果の取扱いについて、適切に管理・遂行出来る体制を有していること。

提案書等の提出期限及び提出先
（１）提出期限
　　平成１９年１２月２６日（水）１７：００必着
（２）提出先
〒１５１－００６６　東京都渋谷区西原２－４９－１０
独立行政法人製品評価技術基盤機構
バイオテクノロジー本部ゲノム構造解析課　高橋　保（宛）
　　　電話：０３（３４８１）８４２３
　　　FAX：０３（３４８１）１９６２
なお、ファクシミリ及びE-mailでの提案書の提出は受け付けておりません。
本件に関するお問合せ先
　〒１５１－００６６
　東京都渋谷区西原２－４９－１０
　独立行政法人製品評価技術基盤機構
　バイオテクノロジー本部ゲノム構造解析課　堀川、高橋
　　　電話：０３（３４８１）８４２３
　　　FAX：０３（３４８１）１９６２
　　　　E-mail：gcollabo　＠ bio.nite.go.jp

独立行政法人製品評価技術基盤機構
バイオテクノロジーセンター　計画課（東京）

〒151-0066
東京都渋谷区西原2-49-10
TEL：03-3481-1933　FAX：03-3481-8424

Mail：	bio@nite.go.jp
地図：	広域地図詳細地図［かずさ（千葉）／本所（東京）］