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ゲノム解析部門(NGAC)
嫌気性超好熱古細菌 (Pyrococcus horikoshii OT3T(= NBRC 100139T))
 ゲノム解析部門で最初に解析の対象として選定したPyrococcus horikoshii OT3T(= NBRC 100139T)は、潜水艇「しんかい 2000」を用いた「DeepStar計画」によって沖縄海溝内の熱水鉱床付近から単離された超好熱古細菌です。
 このP. horikoshii OT3T(= NBRC 100139T)は絶対嫌気性であり、硫黄の存在下で88 ℃から104 ℃(至適生育温度:98 ℃)の温度範囲で生育し、ゲノムは環状DNAであるなどの特徴をもっています。

 P. horikoshii OT3T(= NBRC 100139T)のゲノム(1.74メガ塩基対)の解析結果から推定される2,061個の遺伝子や、高温で生育するこの菌の生産するタンパク質の耐熱性の特徴を解析することは、タンパク質化学的にも興味深いことですし、さらに耐熱性を利用した新しい有機物質製造プロセスの開発にも貢献することが期待されます。

Pyrococcus horikoshii OT3 図
Dr. Masuchi (Jet Propulsion Lab.) 提供

ゲノムサイズ: 1,738,505塩基対(約1.74M bp)
ORF(推定遺伝子領域) 2,061箇所
GC含量: 41.9%
発表論文: Complete Sequence and Gene Organization of the Genome of a Hyper thermophilic Archaebacterium,Pyrococcus horikoshii OT3.
(超好熱古細菌 Pyrococcus horikoshii OT3ゲノムの全塩基配列とその遺伝子構成)
DNA Res. 5(2), 55-76 (1998)
[supplement : DNA Res. 5(2), 147-156 (1998)]
データベース: DOGAN
NBRC*番号: 100139T
(*)NBRCホームページ: http://www.nbrc.nite.go.jp/


塩基配列決定時に使用したゲノムDNAクローンの分譲について
バイオテクノロジー本部(DOB)では、塩基配列決定時に使用したゲノムDNAクローンの分譲を生物遺伝資源部門(NBRC)において行っています。

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