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Halsto_00030
CDS information : Halsto_00040
Location
| Organism | Streptomyces halstedii |
|---|---|
| Strain | HC34 |
| Entry name | Halstoctacosanolide |
| Contig | AB241068 |
| Start / Stop / Direction | 50,682 / 66,650 / + [in whole cluster] 50,682 / 66,650 / + [in contig] |
| Location | 50682..66650 [in whole cluster] 50682..66650 [in contig] |
| Type | CDS |
| Length | 15,969 bp (5,322 aa) |
Annotation
| Category | 1.1 PKS |
|---|---|
| Product | polyketide synthase |
| Product (GenBank) | type I polyketide synthase |
| Gene | |
| Gene (GenBank) | hlsD |
| EC number | |
| Keyword | |
| Note | |
| Note (GenBank) | |
| Reference |
|
PKS/NRPS Module
| 10 |  | methylmalonyl-CoA |
| 11 |  | malonyl-CoA |
| 12 |  | malonyl-CoA |
Sequence
>polyketide synthase [type I polyketide synthase] MSNEDRLRHFLNEVTSELIDTRQRLNDVTAAAEEPLAIVGMACQYPGDVRSPEDLWKLVA EGRDGISEFPTERGWDVDGLYHPDPEHQGTSYTREGGFLHRAGEFDAGFFGISPREALAM DPQQRLLLETSWEAIESAGIDPLSLKGSSTGVFTGVMYHDYSTQLRTVPDGVEAFLGTGN AGSVVSGRIAYVLGAEGPAVTIDTACSSSLVALHLACQALRQGDCTMALAGGVTVMATPG TFVDFSRQRGLAVDGRCKSFAAAADGTGWAEGVGVLVVERLSDAERLGHPILAVVRSSAV NQDGASNGLTAPNGPSQERVIRQALSAAGLSTADVDAVEAHGTGTNLGDPIEAQALLATY GQGRPEGRPLRLGSLKSNIGHTQAAAGVAGVIKMVMALRHGVLPATLHVDEPTPHVDWAS GAVELLTEAMPWPEVGRPRRAAVSSFGISGTNAHIVVEQAPESQIEVAASREETPAGSVA WVVSGHGVDGVQAQAARLREWVLEHPQHSVTDIGFSLLSSRSLHRDRLVVLGSDRQVLVD GLAAAAEGSPWPGLVQSSGDVSLNRAVFVFPGQGSQWVGMGRELYASSPVFRARLDECAA ALDPLVEWSLIDVVRGGSGAPGLERVDVVQPVLWAVMVSLAAVWESWGVVPAAVVGHSQG EIAAACVAGALSVEDAARVVALRSRAVRAMAGDGAMVSVALPAAEAEALTGDGVSLAAVN GPSSVVLSGDRSALTPVVEGLTAQGVRTKWVPVDYASHSAHMDRIHDELLEILSGIEPKT SRIPLYSTVSAEVIDTSVMDAGYWFDNIRGTVRFHETVQALITDGLTAFVEISPHPVLAM SVQDTLDQAEATGLSIGTLRRDENEHETFLTAAAQLFVAGLSIDWHTAAFADLDTRRVDL 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>polyketide synthase [type I polyketide synthase] ATGAGCAACGAAGACCGACTTCGGCATTTCCTCAACGAAGTGACCTCCGAGCTGATCGAC ACGCGTCAGCGGCTCAATGACGTCACGGCCGCCGCTGAAGAGCCACTGGCTATTGTGGGA ATGGCCTGCCAATATCCAGGTGATGTAAGGTCGCCGGAGGACCTGTGGAAATTGGTCGCC GAGGGACGCGACGGGATATCCGAGTTCCCGACGGAACGCGGCTGGGACGTGGACGGTCTC TACCACCCCGACCCGGAGCACCAGGGCACTTCGTACACTCGTGAGGGCGGCTTCCTGCAC CGCGCCGGTGAGTTCGATGCGGGCTTCTTCGGGATCTCGCCGCGTGAGGCGCTGGCGATG GACCCCCAGCAGCGTCTCCTCCTGGAAACCTCCTGGGAGGCGATCGAGAGCGCGGGAATC GACCCGCTCTCCCTGAAGGGCAGCTCGACCGGTGTCTTCACCGGTGTCATGTACCACGAC TACTCGACCCAACTGCGGACCGTGCCCGATGGAGTCGAGGCATTCCTCGGCACGGGCAAC GCGGGCAGTGTCGTGTCCGGGCGAATCGCCTATGTGCTCGGCGCCGAGGGCCCGGCAGTG ACCATTGACACGGCCTGCTCATCGTCCCTGGTAGCCCTGCATTTGGCATGTCAGGCCCTG CGCCAGGGCGACTGCACCATGGCGCTGGCCGGTGGTGTCACCGTGATGGCGACGCCGGGA ACATTTGTGGATTTCAGCCGTCAGCGGGGTCTGGCGGTGGACGGCCGGTGCAAGTCCTTC GCCGCCGCTGCGGACGGTACCGGCTGGGCCGAGGGCGTCGGTGTACTGGTGGTGGAGCGG CTCTCGGACGCGGAGCGCCTGGGCCACCCGATCCTTGCGGTGGTCCGTTCCAGTGCGGTG 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Feature
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|---|---|
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IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
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IPR013154 Alcohol dehydrogenase GroES-like (Domain)
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IPR014031 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (Domain)
IPR014043 Acyl transferase (Domain)
IPR015083 Polyketide synthase, docking (Domain)
IPR016035 Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (Domain)
IPR016036 Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (Domain)
IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain)
IPR016039 Thiolase-like (Domain)
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
IPR018201 Beta-ketoacyl synthase, active site (Active_site)
IPR020801 Polyketide synthase, acyl transferase domain (Domain)
IPR020806 Polyketide synthase, phosphopantetheine-binding (Domain)
IPR020807 Polyketide synthase, dehydratase domain (Domain)
IPR020841 Polyketide synthase, beta-ketoacyl synthase region (Region)
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|
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