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微生物 : Enterococcus haemoperoxidus

微生物株情報

NBRC番号 100709
学名 Enterococcus haemoperoxidus
別名（シノニム） 該当データなし
由来 CCM 4851 <- B. Otipka, 440
他保存機関番号 ATCC BAA-382=CCM 4851=CCUG 45916=CIP 107129=DSM 15920=KCTC 13190=LMG 19487
他株番号 440
参考文献
11491359
Enterococcus haemoperoxidus sp. nov. and Enterococcus moraviensis sp. nov., isolated from water. (Int J Syst Evol Microbiol. 2001)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseI583_00116
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-nucleotidyltransferase)(NFUNC_0042)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseI583_02154
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseI583_02599
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component II583_02600
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseI583_00829
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseI583_01452
Fosfomycin resistance(NFUNC_0023)
必須C
FOSX
(NRULE_0100)
Fosfomycin resistance protein FosXI583_00063
O-Glycan degradation(NFUNC_0084)
必須A
ENGBF
(NRULE_0257)
Endo-alpha-N-acetylgalactosaminidaseI583_02558
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseI583_01895
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinI583_00318
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinI583_00665
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinI583_00665
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinI583_00666
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseI583_02154
Tyramine biosynthesis(NFUNC_0079)
必須A
TYRDC
(NRULE_0248)
Pyridoxal-dependent tyrosine decarboxylaseI583_01795
任意 
TYRP
(NRULE_0249)
Tyrosine permeaseI583_01796
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinI583_00131
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinI583_00771 I583_00130 I583_00132
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinI583_00772 I583_00133

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA191901
ローカスタグ
INSDC entriesASVY01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数3
サイズ(bp) 3,578,766
遺伝子数 3,207
フィニッシングゴール
アセンブル方法allpaths v. R44557
冗長度144.0x
シーケンス方法
  • Illumina
  • PacBio
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
1.1 MB 976.0 KB 639.5 KB 241.0 KB