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微生物 : Acetobacter tropicalis

微生物株情報

NBRC番号 101654
学名 Acetobacter tropicalis
別名(シノニム) 該当データなし
由来 Yamaguchi Univ. (K. Matsushita, SKU1100)
他保存機関番号 BCC 36194
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseATPR_1887 ATPR_0471
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AATPR_0478
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseATPR_1709
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IATPR_1708
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseATPR_0608
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AATPR_0478
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinATPR_1113
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinATPR_0832
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinATPR_0832
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AATPR_0478
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseATPR_0355
任意 
FDR1
(NRULE_0032)
Oxygenase electron transfer componentATPR_0367
 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinATPR_0338 ATPR_1723 ATPR_1360 ATPR_0999
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseATPR_1507 ATPR_0332 ATPR_0314 ATPR_0354 ATPR_2185
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseATPR_3027
任意 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BATPR_3028
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein EATPR_3003
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseATPR_1601
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseATPR_1603
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeATPR_1604

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDA46891
ローカスタグ
INSDC entriesBABS01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数773
サイズ(bp) 3,718,538
遺伝子数 3,538
フィニッシングゴール
アセンブル方法Velvet v. 0.7.28
冗長度64X
シーケンス方法
  • Illumina
  • Solexa
参考文献
  • Increased number of Arginine-based salt bridges contributes to the thermotolerance of thermotolerant acetic acid bacteria, Acetobacter tropicalis SKU1100. (Biochem Biophys Res Commun. 2011) PMID: 21554859

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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FASTA
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1.1 MB 997.9 KB 655.2 KB 253.2 KB