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微生物 : Niastella koreensis

微生物株情報

NBRC番号 106392
学名 Niastella koreensis
別名（シノニム） 該当データなし
由来 KACC 11465 <- H.-W. Weon, GH20-10
他保存機関番号 DSM 17620=KACC 11465
他株番号 GH20-10
参考文献
16902007
Niastella koreensis gen. nov., sp. nov. and Niastella yeongjuensis sp. nov., novel members of the phylum Bacteroidetes, isolated from soil cultivated with Korean ginseng. (Int J Syst Evol Microbiol. 2006)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseNiako_5631
Alginate degradation(NFUNC_0062)
必須B
ALY
(NRULE_0227)
Alginate lyaseNiako_4104 Niako_5220
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseNiako_2531
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseNiako_6936
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DNiako_6692
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須D
ERE
(NRULE_0168)
Erythromycin esteraseNiako_6162
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinNiako_1965
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinNiako_1965
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinNiako_1964
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseNiako_1524
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseNiako_2585
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseNiako_4263
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseNiako_1525
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DNiako_6692
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseNiako_3123
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseNiako_3124
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeNiako_3122
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseNiako_0703

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA42711
ローカスタグNIAKO
INSDC entriesCP003178
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 9,033,684
遺伝子数 7,174
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
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2.7 MB 2.4 MB 1.6 MB 549.8 KB