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微生物 : Chitinophaga pinensis

微生物株情報

NBRC番号 15968
学名 Chitinophaga pinensis
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15968 <- DSM 2588 <- UQM 2034 <- V. Sangkhobol & V.B.D. Skerman
他保存機関番号 ATCC 43595=DSM 2588=LMG 13176=NCIMB 11800=UQM 2034
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCpin_0233
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseCpin_2707 Cpin_1692 Cpin_2757 Cpin_3545
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCpin_1257
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCpin_2241 Cpin_5188
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCpin_5188 Cpin_2241
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinCpin_2242
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseCpin_1035
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseCpin_2573
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseCpin_2574
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeCpin_2576

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA27951
ローカスタグCPIN
INSDC entriesCP001699
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 9,127,347
遺伝子数 7,192
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Chitinophaga pinensis type strain (UQM 2034). (Stand Genomic Sci. 2010) PMID: 21304681

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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2.7 MB 2.4 MB 1.7 MB 546.6 KB