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微生物 : Chthoniobacter flavus

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Chthoniobacter flavus
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 Ellin428
参考文献
21460085
Genome sequence of Chthoniobacter flavus Ellin428, an aerobic heterotrophic soil bacterium. (J Bacteriol. 2011)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCfE428DRAFT_4525
Alginate degradation(NFUNC_0062)
必須B
ALY
(NRULE_0227)
Alginate lyaseCfE428DRAFT_1594
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須B
AAC6
(NRULE_0150)
Aminoglycoside N(6')-acetyltransferaseCfE428DRAFT_6550
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseCfE428DRAFT_4910
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseCfE428DRAFT_0598
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ICfE428DRAFT_0599
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseCfE428DRAFT_0360
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCfE428DRAFT_6252
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DCfE428DRAFT_3931
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCfE428DRAFT_1997 CfE428DRAFT_5019 CfE428DRAFT_5745 CfE428DRAFT_0280
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCfE428DRAFT_0280 CfE428DRAFT_5745 CfE428DRAFT_5019 CfE428DRAFT_1997
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseCfE428DRAFT_1579
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseCfE428DRAFT_0875
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseCfE428DRAFT_3880
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseCfE428DRAFT_5928
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DCfE428DRAFT_3931
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseCfE428DRAFT_2149
任意 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BCfE428DRAFT_2150
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein ECfE428DRAFT_2147
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseCfE428DRAFT_4910
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseCfE428DRAFT_1955
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseCfE428DRAFT_3231 CfE428DRAFT_1956
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeCfE428DRAFT_1822 CfE428DRAFT_4836 CfE428DRAFT_6123 CfE428DRAFT_5239
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseCfE428DRAFT_1957

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA28531
ローカスタグCFE428
INSDC entriesABVL00000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数62
サイズ(bp) 7,848,700
遺伝子数 6,251
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
2.3 MB 2.2 MB 1.4 MB 553.9 KB