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微生物 : Aeropyrum pernix

微生物株情報

NBRC番号 100138
学名 Aeropyrum pernix
別名（シノニム） 該当データなし
由来 JCM 9820 <- N. Nomura, K1
他保存機関番号 ATCC 700893=DSM 11879=JCM 9820
他株番号 K1
参考文献
8863437
Aeropyrum pernix gen. nov., sp. nov., a novel aerobic hyperthermophilic archaeon growing at temperatures up to 100 degrees C. (Int J Syst Bacteriol. 1996)
9658008
Molecular characterization and postsplicing fate of three introns within the single rRNA operon of the hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix K1. (J Bacteriol. 1998)
10086839
Purification and characterization of an intracellular heat-stable proteinase (pernilase) from the marine hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix K1. (Extremophiles. 1999)
10382966
Complete genome sequence of an aerobic hyper-thermophilic crenarchaeon, Aeropyrum pernix K1. (DNA Res. 1999)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseAPE_1458
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinAPE_1635.1 APE_1732 APE_0043.1
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAPE_0272.1
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAPE_0272.1
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSAPE_0246.1
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTAPE_0244.1

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA211
ローカスタグAPE
INSDC entriesBA000002
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,669,696
遺伝子数 1,700
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of an aerobic hyper-thermophilic crenarchaeon, Aeropyrum pernix K1. (DNA Res. 1999) PMID: 10382966
  • Proteome analysis of an aerobic hyperthermophilic crenarchaeon, Aeropyrum pernix K1. (Mol Cell Proteomics. 2006) PMID: 16455681
  • Characterization of a whole set of tRNA molecules in an aerobic hyper-thermophilic Crenarchaeon, Aeropyrum pernix K1. (DNA Res. 2005) PMID: 16769697

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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505.8 KB 476.0 KB 308.7 KB 133.4 KB