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微生物 : Sulfolobus tokodaii

微生物株情報

NBRC番号 100140
学名 Sulfolobus tokodaii
別名（シノニム） 該当データなし
由来 JCM 10545 <- T. Oshima, 7
他保存機関番号 JCM 10545=DSM 16993
他株番号 7
参考文献
3159431
Membrane-bound ATPase of a thermoacidophilic archaebacterium, Sulfolobus acidocaldarius. (Biochim Biophys Acta. 1985)
11572479
Complete genome sequence of an aerobic thermoacidophilic crenarchaeon, Sulfolobus tokodaii strain7. (DNA Res. 2001)
11878560
Sulfolobus tokodaii sp. nov. (f. Sulfolobus sp. strain 7), a new member of the genus Sulfolobus isolated from Beppu Hot Springs, Japan. (Extremophiles. 2002)
14673752
Cellular polyamines of the acidophilic, thermophilic and thermoacidophilic archaebacteria, Acidilobus, Ferroplasma, Pyrobaculum, Pyrococcus, Staphylothermus, Thermococcus, Thermodiscus and Vulcanisaeta. (J Gen Appl Microbiol. 2003)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseSTK_18130
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseSTK_10750
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinSTK_20340
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinSTK_20340
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseSTK_00630 STK_16590 STK_07260
任意 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinSTK_01340 STK_01080 STK_23920 STK_22790 STK_16660 STK_11710 STK_10210 STK_07180
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseSTK_07230
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthaseSTK_04040
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSSTK_14410
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTSTK_14420

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA246
ローカスタグSTK
INSDC entriesBA000023
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,694,756
遺伝子数 2,816
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
  • Sanger ABI3730
参考文献
  • Complete genome sequence of an aerobic thermoacidophilic crenarchaeon, Sulfolobus tokodaii strain7. (DNA Res. 2001) PMID: 11572479

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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