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微生物 : Methanocella paludicola

微生物株情報

NBRC番号 101707
学名 Methanocella paludicola
別名(シノニム) 該当データなし
由来 Nagaoka Univ. Technol. (S. Sakai & H. Imachi, SANAE)
他保存機関番号 JCM 13418=DSM 17711
他株番号 SANAE
参考文献
17483259
Isolation of key methanogens for global methane emission from rice paddy fields: a novel isolate affiliated with the clone cluster rice cluster I. (Appl Environ Microbiol. 2007)
18398197
Methanocella paludicola gen. nov., sp. nov., a methane-producing archaeon, the first isolate of the lineage 'Rice Cluster I', and proposal of the new archaeal order Methanocellales ord. nov. (Int J Syst Evol Microbiol. 2008)
21829548
Genome sequence of a mesophilic hydrogenotrophic methanogen Methanocella paludicola, the first cultivated representative of the order Methanocellales. (PLoS One. 2011)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseMCP_2911
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IMCP_2912
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseMCP_2587
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMCP_1863
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRMCP_1074 MCP_1072
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMCP_1863
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSMCP_1448
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTMCP_1664

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDA20361
ローカスタグMCP
INSDC entriesAP011532
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,957,635
遺伝子数 3,004
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Isolation of key methanogens for global methane emission from rice paddy fields: a novel isolate affiliated with the clone cluster rice cluster I. (Appl Environ Microbiol. 2007) PMID: 17483259
  • Methanocella paludicola gen. nov., sp. nov., a methane-producing archaeon, the first isolate of the lineage 'Rice Cluster I', and proposal of the new archaeal order Methanocellales ord. nov. (Int J Syst Evol Microbiol. 2008) PMID: 18398197

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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FASTA
gz
FASTA
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895.9 KB 818.8 KB 539.0 KB 227.2 KB