English site

微生物 : Streptococcus equinus

微生物株情報

NBRC番号 12553
学名 Streptococcus equinus
別名(シノニム) Streptococcus bovis
由来 IFO 12553 <- ATCC 9812 <- J.M. Sherman, H-12B
他保存機関番号 ATCC 9812=DSM 20558
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0819_1153
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseHMPREF0819_0030
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IHMPREF0819_0029
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0819_1682
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeHMPREF0819_1246
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHMPREF0819_1458
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSHMPREF0819_0562
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTHMPREF0819_0561

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA52999
ローカスタグHMPREF0819
INSDC entriesAEVB01000000
ステータスWGS
解析状況Standard Draft
コンティグ数57
サイズ(bp) 1,718,633
遺伝子数 1,793
フィニッシングゴールStandard Draft
アセンブル方法Newbler Assembler v. 2.3-042010
冗長度59.68x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
519.7 KB 496.2 KB 329.0 KB 152.5 KB