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微生物 : Staphylococcus epidermidis

微生物株情報

NBRC番号 12993
学名 Staphylococcus epidermidis
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 12993 <- ATCC 12228 <- FDA PCI 1200
他保存機関番号 ATCC 12228=CIP 68.21=DSM 1798=IAM 12012=NCIB 8853=WHO 12
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseSE_1674
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ASE_1608
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須B
AZR
(NRULE_0237)
NADPH azoreductaseSE_0330
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須B
ARSB1
(NRULE_0015)
Arsenical pump membrane proteinSE_0135
ARSC2
(NRULE_0018)
Arsenate reductaseSE_0134
任意 
ARSA
(NRULE_0014)
Arsenical pump-driving ATPaseSE_0137
 
ARSD
(NRULE_0020)
Arsenical resistance operon trans-acting repressor ArsDSE_0138
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseSE_0454
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ASE_1608
Betaine biosynthesis (from choline)(NFUNC_0049)
必須A
BETA
(NRULE_0175)
Choline dehydrogenaseSE_2165
Fosfomycin resistance(NFUNC_0023)
必須B
FOSB
(NRULE_0099)
Metallothiol transferase FosBSE_0231
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseSE_0085
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinSE_1852 SE_0075 SE_2398
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinSE_2398 SE_0075 SE_1852
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinSE_1851
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseSE_2139
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseSE_2141
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseSE_2142 SE_2009
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseSE_2140
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ASE_1608
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinSE_0224
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinSE_2017 SE_0223 SE_0225 SE_2015
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinSE_2018 SE_0222
C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterSE_1031 SE_2168 SE_0259
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterSE_1587
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSSE_2262
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTSE_2261

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA279
ローカスタグSE
INSDC entriesAE015929
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数7
サイズ(bp) 2,564,615
遺伝子数 2,485
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Genome-based analysis of virulence genes in a non-biofilm-forming Staphylococcus epidermidis strain (ATCC 12228). (Mol Microbiol. 2003) PMID: 12950922

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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FASTA
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