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微生物 : Sphingobacterium spiritivorum

微生物株情報

NBRC番号 14948
学名 Sphingobacterium spiritivorum
別名(シノニム) Flavobacterium spiritivorum
Flavobacterium yabuuchiae
由来 IFO 14948 <- GIFU 3101 <- CDC E7288
他保存機関番号 ATCC 33861=CCUG 13224=CIP 100542=GIFU 3101=JCM 1277=JCM 6897=LMG 8347=NCTC 11386
他株番号 CDC E7288
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0766_12068
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-nucleotidyltransferase)(NFUNC_0042)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseHMPREF0766_13341
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBHMPREF0766_12632 HMPREF0766_14340
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseHMPREF0766_14305
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0766_14062
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須C
BLAC
(NRULE_0124)
Beta-lactamase class CHMPREF0766_12891
Cephalosporin resistance(NFUNC_0048)
必須A
BLAC
(NRULE_0124)
Beta-lactamase class CHMPREF0766_12891
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須B
CAT4
(NRULE_0108)
Chloramphenicol acetyltransferaseHMPREF0766_13879
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0766_11063
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0766_11063
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseHMPREF0766_14208
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須A
ANT6
(NRULE_0151)
Aminoglycoside 6-adenylyltransferaseHMPREF0766_13341
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseHMPREF0766_13135
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseHMPREF0766_13135
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterHMPREF0766_14070

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA31531
ローカスタグHMPREF0766
INSDC entriesACHA00000000
ステータスWGS
解析状況Improved High-Quality Draft
コンティグ数15
サイズ(bp) 5,091,512
遺伝子数 4,471
フィニッシングゴールImproved High-Quality Draft
アセンブル方法Newbler Assembler v. 2.3-10192009
冗長度23x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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TSV
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1.5 MB 1.5 MB 975.2 KB 381.5 KB