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微生物 : Lactobacillus reuteri

微生物株情報

NBRC番号 15892
学名 Lactobacillus reuteri
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15892 <- JCM 1112 <- DSM 20016 <- G. Reuter, F275
他保存機関番号 ATCC 23272=DSM 20016=JCM 1112
他株番号 F275=NCDO 2589
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLAR_0245
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseLAR_0694
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ALAR_1450
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ALAR_1450
Histamine biosynthesis(NFUNC_0078)
必須A
HDCA
(NRULE_0244)
Histidine decarboxylase proenzymeLAR_1717
任意 
HDCP
(NRULE_0246)
Histidine/histamine antiporterLAR_1718
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseLAR_0563
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeLAR_1441
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ALAR_1450
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseLAR_0694

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDA19011
ローカスタグ
INSDC entriesAP007281
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,039,414
遺伝子数 1,820
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Comparative genome analysis of Lactobacillus reuteri and Lactobacillus fermentum reveal a genomic island for reuterin and cobalamin production. (DNA Res. 2008) PMID: 18487258

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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FASTA
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FASTA
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TSV
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619.6 KB 525.6 KB 359.6 KB 133.9 KB