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微生物 : Chitinivibrio alkaliphilus

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Chitinivibrio alkaliphilus
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 DSM 24538
他株番号 ACht1
参考文献
24112708
Genome analysis of Chitinivibrio alkaliphilus gen. nov., sp. nov., a novel extremely haloalkaliphilic anaerobic chitinolytic bacterium from the candidate phylum Termite Group 3. (Environ Microbiol. 2014)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCALK_1625
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCALK_1262
Ectoine biosynthesis(NFUNC_0056)
必須A
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseCALK_1395
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseCALK_1396
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseCALK_1394
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須D
ERE
(NRULE_0168)
Erythromycin esteraseCALK_1133
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterCALK_2458

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA195589
ローカスタグCALK
INSDC entriesASJR01000000
ステータスContig
解析状況
コンティグ数99
サイズ(bp) 2,591,328
遺伝子数 2,304
フィニッシングゴール
アセンブル方法Newbler v. 2.8
冗長度34.0x
シーケンス方法
  • 454
参考文献
  • Genome analysis of Chitinivibrio alkaliphilus gen. nov., sp. nov., a novel extremely haloalkaliphilic anaerobic chitinolytic bacterium from the candidate phylum Termite Group 3. (Environ Microbiol. 2014) PMID: 24112708

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
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TSV
uncompressed
789.7 KB 755.7 KB 496.1 KB 173.9 KB