English site

微生物 : Methanococcus maripaludis

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Methanococcus maripaludis
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 C5
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseMmarC5_0063
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseMmarC5_0441
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinMmarC5_0977 MmarC5_1759
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMmarC5_0489 MmarC5_1444 MmarC5_1094 MmarC5_1757 MmarC5_1453
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRMmarC5_1664
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinMmarC5_0489 MmarC5_1094 MmarC5_1444 MmarC5_1453 MmarC5_1757
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinMmarC5_1454 MmarC5_1445 MmarC5_1093
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinMmarC5_1455
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterMmarC5_1465
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSMmarC5_1573
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTMmarC5_1753

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA17641
ローカスタグMMARC5
INSDC entriesCP000609
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,780,761
遺伝子数 1,822
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
534.4 KB 499.1 KB 331.5 KB 147.0 KB