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微生物 : Archaeoglobus profundus

微生物株情報

NBRC番号 100127
学名 Archaeoglobus profundus
別名(シノニム) 該当データなし
由来 DSM 5631 <- K.O. Stetter & S. Burggraf, AV18
他保存機関番号 DSM 5631=JCM 9629
他株番号 AV18
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinArcpr_0800 Arcpr_1814
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRArcpr_0927
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinArcpr_1814 Arcpr_0800
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseArcpr_1593
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseArcpr_1593
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSArcpr_0680
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTArcpr_0681

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA32583
ローカスタグ
INSDC entriesCP001857
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 1,563,423
遺伝子数 1,823
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Archaeoglobus profundus type strain (AV18). (Stand Genomic Sci. 2010) PMID: 21304717

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
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475.6 KB 446.9 KB 314.3 KB 140.9 KB