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微生物 : Thermus thermophilus

微生物株情報

NBRC番号 101085
学名 Thermus thermophilus
別名(シノニム) 該当データなし
由来 Tokyo Univ. Pharmacy Life Science (T. Oshima & A. Yamagishi, HB27)
他保存機関番号 ATCC BAA-163=DSM 7039
他株番号
参考文献
15064768
The genome sequence of the extreme thermophile Thermus thermophilus. (Nat Biotechnol. 2004)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseTT_C1944
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside O-phosphotransferase)(NFUNC_0043)
必須A
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseTT_C0815
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseTT_C1492
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ITT_C1493
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseTT_C1132
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTT_C1814
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseTT_C0789
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTT_C0211 TT_C0611
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTT_C0011 TT_P0039 TT_C1726 TT_C1264 TT_C0365
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTT_C0365 TT_P0039 TT_C1726 TT_C1264 TT_C0011
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinTT_C0364
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseTT_C0594
任意 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinTT_C1034 TT_C1568 TT_C1490
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseTT_P0050 TT_C0052 TT_C0595 TT_C1507
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseTT_C0697
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2TT_C0697
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDTT_C0699
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseTT_C1647
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseTT_C0698
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFTT_C0159
Streptomycin resistance(NFUNC_0054)
必須C
APH6
(NRULE_0155)
Streptomycin 6-kinaseTT_C0815
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSTT_C0352
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTTT_C0355

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA10617
ローカスタグTT
INSDC entriesAE017221
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 2,127,482
遺伝子数 2,210
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • The genome sequence of the extreme thermophile Thermus thermophilus. (Nat Biotechnol. 2004) PMID: 15064768

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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