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微生物 : Thermotoga thermarum

微生物株情報

NBRC番号 107925
学名 Thermotoga thermarum
別名(シノニム) 該当データなし
由来 DSM 5069 <- K.O. Stetter & R. Huber, LA3
他保存機関番号
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTheth_0271
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTheth_1625 Theth_0794 Theth_0983
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTheth_1386 Theth_0802 Theth_0340
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTheth_0802 Theth_1386 Theth_0340
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseTheth_1645
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Theth_1645
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDTheth_1643
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseTheth_1646
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseTheth_1644
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthaseTheth_1807
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSTheth_1830
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTTheth_1831

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA41517
ローカスタグTheth
INSDC entriesCP002351
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,039,943
遺伝子数 1,945
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
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gz
FASTA
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TSV
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617.3 KB 572.6 KB 402.2 KB 155.5 KB