English site

微生物 : Cellulomonas fimi

微生物株情報

NBRC番号 15513
学名 Cellulomonas fimi
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 15513 <- JCM 1341 <- K. Suzuki, CNF 025 <- Ajinomoto Co., Inc. (AJ 1571) <- ATCC 484 <- N.R. Smith, 133
他保存機関番号 ATCC 484=CCUG 24087=CFBP 4254=CIP 102114=DSM 20113=HAMBI 93=IAM 12107=JCM 1341=KCTC 1436=LMG 16345=NCAIM B.01386=NCCB 29016=NCIMB 8980=NCTC 7547=VKM Ac-1411
他株番号 133=AJ 1571=CNF 025=IMET 10687
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCelf_1053 Celf_0506
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseCelf_3011 Celf_3308
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseCelf_2310
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseCelf_0028
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ICelf_1801
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCelf_1778
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DCelf_0189
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseCelf_3663
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinCelf_1253
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCelf_2717 Celf_1254 Celf_0110
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCelf_1254 Celf_2717 Celf_0110
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinCelf_1255
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DCelf_0189
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須C
PHEA2
(NRULE_0084)
Aromatic ring hydroxylaseCelf_2070
任意 
FDR2
(NRULE_0057)
Ferredoxin reductaseCelf_2109
 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinCelf_1228 Celf_2184 Celf_1695 Celf_0256
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseCelf_3463 Celf_2897
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseCelf_2111
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseCelf_2112
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeCelf_2759 Celf_2110
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseCelf_2762
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseCelf_0618
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseCelf_0617
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSCelf_2036
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTCelf_2033

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA33691
ローカスタグCELF
INSDC entriesCP002666
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 4,266,344
遺伝子数 3,762
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
1.2 MB 1.1 MB 788.3 KB 292.1 KB